Nach dem Abschluss seines Studiums als dipl. Elektroingenieur und dipl. Wirtschaftsingenieur war Martin Bütikofer für die amerikanische Reliance Electric AG in der Schweiz, den USA und in England tätig.
Anschliessend übernahm er die Leitung des Amtes für den öffentlichen Verkehr im Kanton Zug. In dieser Funktion initiierte und realisierte er unter anderem den Tarifverbund Zug sowie die Stadtbahn Zug. Mit dem Wechsel zur Schifffahrtsgesellschaft des Vierwaldstättersees (SGV) übernahm er als Direktor die Verantwortung für den Aufbau des werfteigenen Schiffbaus «Shiptec» sowie der Gastronomiefirma «Tavolago». 2005 wurde Martin Bütikofer von der SBB AG als Direktor Regionalverkehr in die Geschäftsleitung Personenverkehr nach Bern berufen.
Seit 2011 ist er Direktor des Verkehrshauses der Schweiz und damit für die Weiterentwicklung der schweizweit grössten und meistbesuchten Plattform rund um das Thema Mobilität. Darüber hinaus engagiert er sich als Verwaltungsrat in verschiedenen Unternehmen des öffentlichen Verkehrs, der Industrie und des Tourismus.
In der Freizeit ist der Vater von drei erwachsenen Kindern als Fotograf in fernen Ländern unterwegs. Im Rahmen von Reisen gibt er als Experte sein Wissen und seine Erfahrungen gerne weiter.